Déconvolution et Analyse 3D

Cette rubrique regroupe les logiciels de déconvolution et analyse 3D disponibles sur la plateforme MICA.

Déconvolution

Déconvolution 

  

   La déconvolution est une opération mathématique utilisée pour corriger les images après acquisition.

   En effet, l'image d'un objet est déformée par les distorsions optiques (diffraction, aberrations).

   Cette distorsion spécifique du système optique utilisé, est appelée "Point Spread Function" (PSF).  

 

   L''image obtenue est le résultat d'une convolution entre l'objet et la PSF du système optique.

   Le processus de déconvolution permet donc à partir de d'une image acquise en 3D, d'utiliser une PSF

   expérimentale ou une PSF théorique, afin de restaurer une image de meilleure résolution. 

   Le logiciel HUYGENS est disponible sur la plateforme MICA pour déconvoluer vos images à l'

et à l'

        
    3Dmiceintestin

Analyse et représentation 3/4D

L'analyse d'images 3D est l'étude de volumes reconstruits à partir de piles d'images de coupes optiques.  

La plateforme MICA Propose l'accès aux logiciels suivants:

 VOLOCITY    

 IMARIS       IRCAN_mailto 

 AMIRA 

 Ces logiciels vous permettront à la fois de visualiser des reconstructions 3D de vos échantillons et de les analyser:

  • Segmentation 3D
  • Comptage d'objets
  • Co-localisation
  • Analyses morphologiques
  • Suivi d'objets en 3D